نظریه امام خمینی (ره) در نظام سیاسی جمع مشروطه و مشروعه است. ایشان جریان شیخ فضل الله و مشروطه خواهان را زمانی مطرح کرد که بحث جبهه ملی و فضای انحرافی و غربزدگی در انقلاب بروز کرد.
پس از 15 سال از واقعه مشروطه و با کودتای 1299 رضاخان میرپنج، شاهد تغییر جهتی شگرف در میان برخی از این رهبران قدیم و جدید هستیم و آن حمایت از استبداد رضاشاهی است. گویی استبداد تنها با پسوند قاجار و تعلق به گذشته امری کهنه و ناپسند است و استبداد مدرن امری لازم.
موسی نجفی با انتقاد از روشنفکران عرفی که به علت مواضع گوناگون شیخ فضلالله در مواجهه با مشروطه، شیخ را متهم به دروغگویی کردند و اتهام دیگری که به شیخ وارد میکرده که از پادشاه قاجار پول دریافت کرد پاسخ داد.
فرزند علامه «فضلالله» با اشاره به اینکه اندیشههای رهبری انقلاب ایران ریشه در افکار امام خمینی دارد، تصریح کرد که بهواسطه برخورداری از چنین اندیشههایی ایشان توانسته به ساختارها و آینده سیاسی، اقتصادی و اجتماعی ایران سمت و سو دهد.