به گزارش دیدبان به نقل از شهدای ایران، محمدعلی نجفی از مشاوران نزدیک خاتمی و از اعضای کارگزاران است که به عنوان وزیر پیشنهادی آموزش و پرورش معرفی شد اما نتوانست رای اعتماد نمایندگان را کسب کند. وی پس از آن از سوی روحانی برای تصدی ریاست سازمان میراث فرهنگی و گردشگری انتخاب شد اما چند ماه بعد استعفا داد.
نجفی در مصاحبه با روزنامه اعتماد گفته است: از روز بعد از رد صلاحیت آقای هاشمی بود که بحث کاندیدای سوم مطرح شد و در حقیقت تا روزی که اطلاعیه شورای مشاوران اصلاح طلبان صادر و از آقای روحانی به شکل رسمی حمایت شد و هم آقای خاتمی و هم آقای هاشمی حمایت خودشان را اعلام کردند، ما به این نتیجه نرسیده بودیم که آقای روحانی کاندیدای اصلاح طلبان شود.
وی درباره ترکیب کابینه می گوید: به نظرم در حقیقت بخش مهمی از کابینه را کسانی تشکیل می دهند که دیدگاه های اصلاح طلبانه چه در مسائل سیاسی و چه در مسائل اقتصادی دارند.
نجفی در بخش دیگری از این مصاحبه می گوید: اعتقادم این بود و به خود آقای روحانی هم گفتم که شما زیاد از ژنرال ها در کابینه تان استفاده نکنید، آنها را به پشت پرده کابینه ببرید تا به عنوان مشاور به شما و وزرای تان کمک کنند، به این ترتیب می شود تصمیم گیری های بهتری داشت. به ایشان گفتم که از نیروهای جوان تر و آماده تر برای امور اجرایی استفاده کنید و از نیروهایی بهره ببرید که آگاهی نسبت به مسائل کشور دارند اما الزاما تئوری پرداز نیستند چون وزیر لازم نیست تئوری پرداز باشد. من باور داشتم که برگرداندن یک نفر به یک وزارتخانه ای که سال ها پیش در آن وزیر بوده، صلاح نیست اما ایشان در مورد خود من همین کار را کردند و درباره آقایان زنگنه و نعمت زاده نیز.
وی درباره روز جلسه رای اعتماد و اینکه «در آن روزی که می خواستید به مجلس بروید، روحانی به شما توصیه ای [درباره فتنه 88] نکرد؟» می گوید آقای روحانی نه اما خیلی از دوستان به من توصیه می کردند که شما خیلی تند صحبت نکنید و یک جمله برائتی، چیزی بگویید و از این سد عبور کنید.
 نجفی در پاسخ این سوال که خود را اصلاح طلب می دانید یا اعتدالگرا گفت: من اصلاح طلب هستم.