حسن روحانی در کتاب خاطرات خود درباره پرونده هسته‌ای و همچنین پذیرش پروتکل الحاقی توسط مجلس شورای اسلامی به نکاتی اشاره می‌کند که با موضع فعلی رییس جمهور تناقضاتی دارد.

مطابق پروتکل الحاقی، بازرسان آژانس به هر مکانی در داخل خاک کشور میزبان دسترسی خواهند داشت در نتیجه امکان بازرسی مراکز هسته ای و حتی مصاحبه با دانشمندان ایرانی برای آژانس فراهم خواهد شد.

بعد از گذشت حدود دو هفته از مذاکرات ژنو، به نظر فرصت مناسب برای بحث کارشناسی درباره آنچه اتفاق افتاد و آنچه مرقوم شد، به خوبی فراهم شده است. تحلیل هایی که می تواند تجربه گرانبهایی را برای مردم ایران فراهم آورد. با توجه به توافق ژنو، متوجه می‌شویم قسمتی از پروتکل الحاقی مبنی بر نظارت روزانه و سرزده توسط بازرسان آژانس توسط تیم هسته‌ای پذیرفته شده است، اما اصل پروتکل الحاقی توسط مجلس به تصویب نرسیده است.

در سال 1997 میلادی شورای حکام آژانس بین‌المللی انرژی اتمی، ترتیبات جدیدی برای تشخیص فعالیت‌های غیرشفاف هسته‌ای کشورها به تصویب رساند که به "پروتکل الحاقی" مشهور شد که تا کنون به امضای 145 کشور رسیده و 121 کشور نیز آن را اجرا کرده‌اند.